Viljandi Muuseumi ajalookogu (tähis Aj) sisaldab suurt hulka väga erinevaid tarbe- ja iluesemeid ning mööblit. Neid on kokku u 3200.

Ajalookogu alakogu faleristikakogu (tähis N-2) sisaldab u 600 museaali autasude valdkonnast.